Подписанный президентом Узбекистана указ «О дальнейшем совершенствовании системы предотвращения коррупции и борьбы с ней в Республике Узбекистан» предусматривает организацию деятельности подразделений внутреннего контроля по противодействию коррупции в государственных органах и организациях в тесном взаимодействии с Агентством по борьбе с коррупцией.
С 1 июля 2026 г. по 2030 г. поэтапно будет внедряться Национальная система сертифицированного управления по противодействию коррупции. В первую очередь система охватит органы и организации, эффективность работы которых по итогам рейтинговой оценки признана «неудовлетворительной». В рамках нового подхода Агентство создаёт целостную систему предупреждения коррупции с постоянным взаимодействием с правоохранительными и контрольными органами, научными учреждениями, подразделениями внутреннего контроля и институтами гражданского общества.